本院與日本筑波大學生命科學與環境研究科之碩士雙學位計畫
適 用 對 象：每學年九月入學之台大新生
期 程：第１學期於台大、第２與第３學期於日本、第４學期返回台大並完成口試及繳交論文
畢 業 學 分：依據兩校及系所制定之課程學分要求
口試委員組成：日方３位委員＋台大２位委員
口 試 次 數：雙邊共同組成之委員一次進行
論 文 題 目：一個
論 文 格 式：依照台大與筑波各別制定之格式撰寫
預定公告日期：每年9月公告至各系所及所屬教師，11月截止收件
預計面試日期：不固定，大約落在隔年一月擇日舉辦雙邊視訊口試
學 位 取 得：兩校畢業規定皆須滿足，且通過口試委員口試後始可取得雙邊個別之學位證書
本院與日本京都大學農學研究科之碩士雙學位計畫
適 用 對 象：每學年９月入學之台大新生
期 程：第１到第３學期於台大、第４與第５學期於日本並完成第一個論文之口試、第６學期返回台大完成第二個論文口試。兩個口試完成後才能取得兩校各別頒發之證書。
畢 業 學 分：依據兩校及系所制定之課程學分要求
口試委員組成：依照日方和台灣各別規定
口 試 次 數：雙邊分兩次個別舉行
論 文 題 目：兩個獨立之論文（領域可相近，須由雙邊教授討論訂定）
論 文 格 式：依照台大與京大各別制定之格式撰寫
預定公告日期：每年約９月公告至各系所及所屬教師，１1月截止收件
預計面試日期：若申請件數超過每年額度，學院將進行審查
學 位 取 得：須滿足兩校畢業規定且完成口試與論文後，始可取得雙邊各別之學位證書。若無法滿足日方畢業規定，僅滿足本校者，僅取得台大學位；若無法滿足本校畢業規定，僅滿足日方規定者，仍無法取得單邊之日方學位，亦即無法取得任一方之學位。
本院與法國波爾多大學理工學院之碩士雙學位計畫
適 用 對 象：每學年九月入學之台大新生
期 程：第１與第２學期於台大、第３與第４學期於法國。於法國完成口試後繳交該校論文；之後返台繳交本校論文。
畢 業 學 分：依據兩校及系所制定之課程學分要求
口試委員組成：法方２位委員＋台大３位委員
口 試 次 數：雙邊共同組成之委員一次進行
論 文 題 目：一個
論 文 格 式：依照台大與波爾多各別制定之格式撰寫
預定公告日期：每年約９月公告至各系所及所屬教師，１1月截止收件
預計面試日期：依系所規定制定。若有，約於同年申請截止後的2個月內完成面試
學 位 取 得：兩校畢業規定皆須滿足，且通過口試委員口試後始可取得雙邊各別頒發之學位證書